全基因组水平蒺藜苜蓿CPP基因家族的鉴定及表达模式分析

作者:田骄阳; 王秋霞; 郑淑文; 刘文献
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CPP丰富的多梳样蛋白基因家族是一类小转录因子,广泛存在于除酵母和原核生物外的各种生物中。它在植物生长发育和逆境反应中起着重要作用。到目前为止,CPP基因家族已经在许多物种中得到鉴定和研究,但在豆科模式植物蒺藜苜蓿上还没有报道。使用生物信息学的方法,在蒺藜苜蓿的中共中鉴定了九个CPP基因。通过构建蛋白序列、CPP基因、CPP三个物种的系统发育树,将基因分为三类,MtCPP成员与大豆的亲缘关系更加密切。保守的结构域分析表明,MtCPP转录因子有1~2个位点。染色体图谱分析显示,9个CPP基因分布在6条染色体上,并鉴定出2对同源基因,均来自片段复制事件。在基因芯片技术检测到MtCPP基因的表达模式。结果表明,MtCPP基因基因的表达具有一定的时空特异性。MtCPP基因启动子含有大量与激素和应激有关的顺式作用元件基因,mtcpp2、mtcpp5、MtCPP6和MtCPP7基因具有应对干旱的表达特征,而mtcpp2和MtCPP8基因则具有应对盐胁迫的功能。本研究为进一步分析MtCPP基因家系的功能和筛选苜蓿抗逆相关基因奠定了基础。