IGF2BP2调控食管癌细胞增殖和凋亡相关基因可变剪接的机制研究
作者:冯静芳; 马兰英; 李凡周; 韩梅
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目的:通过调节基因表达和可变剪接,探讨IGF2bp2在食管癌发生发展中的作用机制。方法:IGF2bp2在人食管癌细胞系ECA109中过度表达,并在转录组测序进行分析。通过分析IGF2bp2调控的差异表达基因和可变剪接基因,探讨了IGF2bp2在食管癌中的作用机制。结果:IGF2bp2过度表达导致158个基因的差异表达,其中81个基因上调,77个基因下调(FC2or,0.5,P<0.01)。GO和KEGG的分析发现,IGF2bp2通过监管差异表达基因影响了食管癌的发生和发展,这可能并不重要。IGF2BP2过度表达了可变剪接景观发生显著变化的基因,在GO分析中,这些基因被富集到GPI锚定的生物合成过程中。主要的富集信号通路是细胞增殖和凋亡。可变剪接基因在细胞增殖中具有丰富的意义。研究发现,在IGF2bp2过度表达后,21个基因(ADAMtsl4、TRIO、PLEKHG2等)在细胞增殖中交替剪接。ALP基因在细胞凋亡中具有丰富的意义,在IGF发现23个ALP基因(CDK11B、osmr、MRE11A等)在2bp2过度表达后调节细胞凋亡。结论:IGF2bp2调控食管癌基因,促进其在可变剪接的发生和发展。
