基于RNA测序的太赫兹波抑制白血病K562细胞转录组学特征分析
作者:陈中; 尚广彬; 傅柳; 柳歌; 陈宣; 张琦; 卢晓南
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为了探索太赫兹波抑制K562细胞存活率基因表达变化的总体情况,揭示其可能的关键信号通路,太赫兹波被用于干预K562细胞。基于RNA测序分析基因表达变化的总体差异,采用生物信息学方法分析了差异表达基因的富集和聚类特征。在一定条件下筛选出1131个差异表达基因基因,包括216个上调基因和915个下调基因。基因本体富集分析结果表明,差异表达基因主要富集在DNA与转录激活剂的结合、RNA聚合酶与DNA的结合、转录因子活性、蛋白质折叠、共价染色质修饰和组蛋白修饰等过程中。京都基因和基因组百科全书的信号通路分析结果表明,差异表达基因主要富集于丝裂原活化蛋白激酶、C型凝集素受体、Notch、Janus激酶信号转导及转录激活因子和转化生长因子——以及其他与K562细胞增殖和凋亡密切相关的信号通路。本研究对揭示太赫兹波对生物效应的影响具有一定的参考价值。
