宫颈癌关键基因及其机制的生物信息学分析

目的利用生物信息学方法探索宫颈癌的关键基因，并分析其可能的机制。方法从GEO数据库中选择5个微阵列数据集（GSE63514、GSE64217、GSE6791、GSE89657、GSE9750）对宫颈癌和差异表达基因进行筛查。GO和KEGG对差异表达基因的富集分析、PPI网络的构建、Cytoscape对核心基因的筛选、核心基因的表达验证、启动子甲基化分析、基因拷贝数分析、免疫分析等。结果通过数据集筛选出90名差异表达基因人，涉及蛋白质结合等分子功能，生物过程，如“细胞分裂”，以及参与“细胞周期”等途径。通过PPI网络选择了五个核心基因，即CDK1、CCNA2、CCNB1、Cdc20和TOP2A。这五个核心基因在宫颈癌高度表达，它们的mRNA表达水平与核心基因的拷贝值有关（P<0.05）。核心基因与宫颈癌的免疫细胞浸润有关，主要涉及CD8＋T细胞、CD4＋T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞和树突状细胞（P<0.05），主要涉及C1（伤口愈合）、C2（IFN－显性）和C4（淋巴细胞消耗）。结论CDK1、CCNA2、CCNB1、Cdc20和TOP2A可作为宫颈癌的新生物标志物。基因拷贝数的变化可能会影响核心基因的表达水平，进而改变宫颈癌患者的免疫水平。这项研究为探索宫颈癌的诊断和治疗提供了一个新的视角。