宏基因组二代测序在重症肺炎肺泡灌洗液中的检测优势

目的：探讨宏基因组第二代测序（mNGS）在重症肺炎肺泡灌洗液检测中的优势。方法：选择2019年12月至2021 10月在武汉大学中南医院治疗的70例重症肺炎患者。所有患者均接受mNGS和传统培养（肺泡灌洗液培养和痰培养）。回顾性分析mNGS在重症肺炎患者病原体检测方面的优势。结果：mNGS病原体检测阳性率高于传统培养法（98.6%vs62.9%，P<0.001）。mNGS可以进一步鉴别传统培养阴性和mNGS培养阳性患者的各种病原体感染。在病原体分布方面，mNGS检测到71株细菌、39株真菌和3株病毒细菌。mNGS在混合感染中的阳性率较高（67.1%比12.9%，P<0.001）。此外，在患有基础疾病的患者中，mNGS的检出率病原体含量较高（98.0%比69.4%，P<0.001）。尤其是免疫力低下的患者，mNGS能够识别特殊病原体的感染（肺孢子菌、巨细胞病毒）。结论：mNGS可以改善重症肺炎患者病原微生物的检出率，可作为传统培养阴性重症肺炎患者的辅助检测技术。mNGS在诊断混合感染方面具有优势，可以同时识别多种病原体感染。临床上，建议重症肺炎合并免疫缺陷的患者尽快应用mNGS，以增加临床效益。