基于网络药理学和分子对接探讨真武汤治疗扩张型心肌病的作用机制

作者:孙斯嘉; 冼绍祥; 杨忠奇; 尹克春; 袁天慧
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目的探讨基于网络药理学和分子对接的真武汤治疗扩张型心肌病的机理。方法通过中药系统药理学(TCMSP)数据库和分析平台以及Swiss、Target和Prediction网站获得真武汤的有效化合物和相应靶点,并使用UniProt数据库毒性和基因比较数据库(CTD)将靶点名称转换为基因名称,遗传药理学和药物基因组学数据库(PharmGKB)获得了扩张型心肌病相关基因,并将真武汤靶点基因和扩张型心肌病相关基因的交叉点作为治疗真武汤扩张型心肌病的潜在目标。将交叉基因导入STRING数据库进行蛋白质相互作用分析,使用Cytoscape软件绘制真武汤中药、潜在化合物和潜在靶点的视觉网络图。使用RStudio、基因本体(GO)的ClusterProfiler包功能注释和京都基因和基因组百科全书(KEGG)路径富集分析潜在目标,Pathview包用于代谢路径整合和可视化。最后,通过分子对接对筛选出的关键靶蛋白进行了验证。结果通过筛查,59个真武汤获得了259个药物靶标对应的活性化合物,有980个扩张型心肌病相关靶标和47个潜在靶标,筛选出41个与疾病相关的有效化合物。用TC943和TC943对120条信号通路进行分析。其中,谷甾醇、山奈酚、乙酰氧基苍术酮、北欧乌头碱、芍药新苷、多根乌头碱、茯苓酸B和常春藤皂苷元是治疗真武汤扩张型心肌病的主要活性化合物,而白细胞介素6号(IL6号)、肿瘤坏死因子(TNF)、转录激活因子3号(STAT3号)、表皮生长因子受体(夏洛克·EGFR)和一氧化氮合酶(NOS3)是主要目标,主要通过调节晚期糖基化终末产物-糖基化终末产物受体(age-rage)、缺氧诱导因子-1(simaqian-1)、弓形虫、脂肪细胞脂解、肾素分泌、钙离子等信号通路发挥治疗作用。结论真武汤可能通过谷甾醇、山奈酚、乙酰氧基苍术酮、乌头碱北部和芍药新苷等关键活性成分对IL6号、TNF、STAT3号、夏洛克·EGFR和NOS3等关键靶点发挥作用,并通过调节age rage、simaqian-1、弓形虫、脂肪细胞脂肪分解、肾素分泌、,钙离子等信号通路改善心肌能量代谢,调节免疫功能等机制,起到综合治疗作用。