基于比较转录组学的多花黄精黄酮类化合物合成基因表达分析

作者:叶碧欢; 杨阳; 朱杰丽; 石从广; 陈友吾; 胡传久; 宋其岩; 李海波
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为了研究解毒植物黄精的黄酮类化合物生物合成途径。在多花黄精,利用第二代高通量测序技术研究了培养3个月和9个月的多花黄精组培苗根茎的比较转录组学,为研究黄精属植物黄酮类化合物代谢和调节的分子机制提供数据。结果表明,经过序列组装和功能注释,多花黄精根茎的转录组数据被拼接,共产生73218个单基因序列,其中35511个被注释。共鉴定出83个单基因序列,编码18种参与黄酮类化合物合成的关键酶。在幼苗期根茎中表达的1359个转录因子中,bHLH最为丰富,其次是ERF、C2H2和NAC。FPKM表达分析表明,随着黄酮类化合物在多花黄精块茎中的不断积累,18个酶基因中有9个显著上调,3个显著下调,6个没有显著表达差异。RT-qPCR分析进一步验证了转录组fpkm结果的可靠性。本研究为分析黄精属植物黄酮类化合物的合成和积累机理提供了参考。