基于ITS2序列及二级结构对紫苏与其变种、紫苏子与其混伪品的鉴别

将ITS2号的一级序列与二级结构相结合，用于鉴别紫苏及其变种、紫苏子及其混淆品，从而为紫苏药材的使用提供更科学的分类方法。采集了紫苏及其相关物种和紫苏子混伪品基源的植物样本，并提取了DNA的PCR扩增。所有物种的ITS2序列都是通过组合GenBank的序列获得的。MEGA7.0软件用于分析序列，计算物种间的遗传距离，构建NJ树，并通过ITS2数据库预测每个物种的ITS2二级结构。4sale软件用于比较一级结构和联合二级结构矩阵，ProfDistS软件用于构建PNJ树。ITS2序列扩增成功率高。除了白苏，紫苏和其他变体的ITS2序列还有明显的Barcoding　gap．NJ树，这表明ITS2可以将紫苏和白苏与其他变体区分开来。紫苏和白苏在它的二级结构上是不同的。紫苏子的ITS2序列和它的混淆品是完全不同的，物种之间存在着显著的遗传距离。NJ树和PNJ树的研究表明，紫苏种子及其掺假品分别聚为一个分支，并且具有较高的自我发展支持率。因此，基于ITS2条形码可以准确识别紫苏子及其掺假品，为规范药品市场、确保临床用药安全提供可靠的方法。然而，紫苏及其变种白苏的鉴定需要与其2个二级结构相结合，或者建议将白苏和紫苏合并为一个物种，以便为紫苏属的植物分类提供参考。