SRC1/SRC2双基因敲除小鼠胎肺转录组分析
类固醇激素受体辅激活因子(steroidreceptor coactivators、SRC)显著提高各种类固醇激素受体的转录活性,并在多种生理功能中发挥重要调节作用,如进食、睡眠、应激反应和繁殖。此前的研究发现,SRC1/2双基因敲除(dKOSRC1/2)的小鼠会推迟分娩,部分原因是由于血小板激活因子(PAF)分泌减少导致胎儿肺发育不良和肺表面活性物质相关蛋白-A(SP-A)发育不良。然而,对于SRC1/2dKO小鼠胎肺基因表达的变化,在整个转录组水平上仍缺乏系统的分析。在本研究中,选择了来自SRC1基因敲除(SRC1KOSRC1基因敲除)、SRC2基因敲除(SRC2KOSRC2基因敲除)、SRC1/2dko和野生型(WT)的18.5天妊娠小鼠的胎肺样本。转录组分析在Illumina平台、mRNA测序、差异表达基因、GO和KEGG功能注释和浓缩分析上进行。结果表明,所有样品的基本质量均大于92%。SRC1ko和SRC分别有61和32处不同分别为2ko和WT胎儿肺。基因.SRC1/2、dKO和WT之间有480、11和901个差异基因,SRC1ko和SRC2ko胎儿肺,包括Aspg、Crispld2、Eln、北tsr2Slc10a6和Vgll3是SRC的1/2。与其他基因型相比,dKO是差异表达基因、实时荧光定量PCR、蛋白质和免疫印迹独有的。转录组测序结果可靠。GO对SRC1/2dKO和WT小鼠胎儿肺差异基因的分析表明,差异基因在细胞外空间、细胞外区域和细胞外基质显著富集,并与生物过程中多器官的发育密切相关。对KEGG受体途径和补体吸收途径的分析表明,KEGG受体途径与消化系统的相互作用主要不同。本研究在转录组水平上全面揭示了dKOSRC1/2引起的胎肺基因表达的变化,为研究妊娠期胎肺发育的调控机制和进一步筛选影响分娩起始的胎源性因素提供了新的理论依据。
