拟南芥START结构域亚家族生物信息学分析及功能

作者:李晓凯; 刘霞; 常红娟; 王凤茹
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Start(类固醇生成急性调节蛋白相关脂质转移)广泛存在于动物和植物中。它参与脂质分子的转移,并发挥多种生物学功能。为了阐明拟南芥START结构域家族成员的结构特征和功能机制,本研究以拟南芥的START·结构域亚家族为研究对象,通过生物信息学和qRT-PCR技术对启动子的进化关系、理化性质、基因结构和顺式作用元件进行了分析和比较,分析了拟南芥仅有START亚家族成员的不同组织的表达特征。通过分析只有START亚家族成员的功能获得和功能丧失的转基因-拟南芥幼苗的形态,确定了亚家族成员对拟南芥幼苗生长的调节作用。结果显示,拟南芥START结构域家族有35名成员,其中只有9名START成员。然而,在进化树分析中,At4g26920和At5g07260与其他7个成员不在同一分支,它们的疏水结合位点也不同。在只有START域的亚科成员中,只有At3g23080的不稳定系数小于40,相对稳定,大多数成员是不稳定的蛋白质。基因表达分析表明,只有START结构域亚家族成员具有明显的组织特异性表达特征,并参与了幼苗生长发育的调控,这为进一步探索START结构域调控植物生长发育的生物学功能和机制奠定了基础。