鸭星状病毒3型SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR检测方法的建立

作者:傅秋玲; 张蕊; 傅光华; 万春和; 程龙飞; 施少华; 陈红梅; 刘荣昌; 黄瑜
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鸭星状病毒3型(Duck astrovirus-3,DAs,tV-3)是近年来危害中国养鸭业的一种新病原体。根据从樱桃谷鸭胚胎中分离和鉴定的tV-3分离株DAs的特征,以及毒株报告的RNA依赖核糖核酸聚合酶基因(RNA依赖RNA聚合酶,RDRP),本研究设计了特异性引物,并建立了检测tVDAs-3的SYBR Green实时荧光定量PCR方法。结果表明,在1.15101~1.15107拷贝/L范围内,标准曲线的环域值(Ct)与标准品的模板浓度之间存在良好的线性关系,相关系数R2和扩增效率分别为0.999和2.08。该方法具有很强的特异性,只能检测到DAs的nipol-3,但对常见的鸭病病原体(DAstV-1、DAs)、tV-2、禽流感病毒、H9(亚型禽流感病毒)、禽坦布苏病毒(禽坦布苏病毒)、鸭呼肠孤病毒(Duck reovirus)、番鸭、细小病毒(Muscovy parvovirus))均检测为阴性。其灵敏度高,最低检测限为23份。重复性好,在该批中,批间重复试验和变异系数分别占0.14%~0.65%和0.53%~0.94%,均低于1%。采用该方法对2018年6月至2021年3月间疑似DAsNealP-3感染的209份标本进行检测。tVDAs-3的阳性检出率为56.5%(118/209)。综上所述,本研究建立的方法特异性强、灵敏度高、稳定性好,为DAstV-3感染的快速诊断和流行病学监测提供了有力的技术支持。